Вообще да, у меня есть идея, что в прокете должен быть только код на java/kotlin и всё.
Поэтому долой maven (kotlin-gradle) и долой sh (kotlin-native).
А вообще временами хочется иметь такую фичу- чтобы build, включая тесты, package (в т..ч deb/docker) и deploy были частями приложения (тогда всё это можно отладить).